Les oiseaux ont une composition surprenante de leur microbiome intestinal

Chaque année, des millions d’oiseaux s’écrasent contre les fenêtres des villes au cours de leur migration, nombre d’entre eux perdant la vie. Bien que les collisions de fenêtres soient considérées comme un problème majeur pour diverses espèces d’oiseaux, les corps de ces oiseaux peuvent souvent constituer un trésor d’informations scientifiques.

Dans une étude récente publiée dans la revue Écologie moléculaireune équipe de chercheurs a analysé des échantillons fécaux de 747 oiseaux qui se sont écrasés dans des bâtiments de Chicago sur une période de trois ans pour étudier la composition de leurs microbiomes intestinaux. L’analyse a révélé que la population de micro-organismes présents dans les intestins de ces oiseaux est très différente de celle généralement trouvée chez les mammifères.

« Chez l’homme, le microbiome intestinal – l’ensemble des bactéries, champignons et autres microbes vivant dans notre tube digestif – est extrêmement important pour notre santé générale et peut même influencer notre comportement. Mais les scientifiques tentent encore de déterminer le rôle important du microbiome chez les oiseaux », a déclaré Heather Skeen, associée de recherche au Field Museum de Chicago.

Chez les mammifères, différentes espèces possèdent généralement leurs propres réseaux de microbes intestinaux qui les aident à digérer les aliments et à prévenir les maladies. Selon les études ADN, ces relations remontent souvent à des millions d’années, différentes espèces coévoluant avec leurs microbiomes dans une relation symbiotique bénéficiant à la fois à l’animal et à ses microbes.

Cependant, la situation semble très différente chez les oiseaux. « Les microbiotes intestinaux des oiseaux ne semblent pas être aussi étroitement liés aux espèces hôtes, nous voulons donc savoir ce qui les influence. Le but de cette étude était de voir si les microbiomes des oiseaux sont cohérents ou s’ils changent sur de courtes périodes », a expliqué Skeen.

L’analyse d’échantillons fécaux de 747 oiseaux qui se sont écrasés sur des bâtiments de Chicago, appartenant à quatre espèces communes d’oiseaux chanteurs appelés grives – complétés par des échantillons supplémentaires collectés sur les grives dans leur aire de reproduction estivale au Michigan, au Minnesota et au Manitoba – a révélé que, contrairement aux mammifères , les différentes espèces d’oiseaux ne semblaient pas avoir leur propre ensemble unique de microbes. En revanche, leur microbiome intestinal semblait changer d’une saison à l’autre et d’une année à l’autre. Ces résultats suggèrent que les microbiomes des oiseaux sont davantage liés à l’environnement qui les entoure que celui des mammifères.

Cependant, des recherches supplémentaires sont nécessaires pour clarifier comment les oiseaux parviennent à digérer correctement la nourriture et à avoir un système immunitaire fonctionnel capable de combattre efficacement les parasites, si leur microbiome change autant en quelques mois seulement.

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Par Andreï Ionescu, Espèces-menacées.fr Rédacteur