Les humains propagent des bactéries résistantes aux antimicrobiens à la faune urbaine

Pour la première fois, une souche hautement transmissible de la superbactérie SARM résistante aux antibiotiques, qui sévit actuellement dans les hôpitaux d’Europe du Nord, a été isolée chez des hérissons à Helsinki.

Superbactéries telles que résistantes à la méthicilline Staphylococcus aureus (SARM) sont des bactéries résistantes aux antibiotiques pour lesquelles il existe peu ou pas de traitements disponibles.

Récemment, les hérissons européens, une espèce sauvage commune vivant dans les zones urbaines, se sont révélés être des porteurs naturels du SARM. Des enquêtes menées au Danemark et en Suède suggèrent que jusqu’à 60 pour cent des hérissons sont porteurs d’un type de SARM appelé mecC-SARM, qui est à l’origine d’une infection à SARM sur 200 chez l’homme.

Les résultats suggèrent une propagation des bactéries et des gènes résistants aux antimicrobiens (RAM) vers la faune urbaine. Cette tendance doit être surveillée afin de limiter l’émergence de traits de résistance aux antimicrobiens à l’avenir. La propagation mondiale de ces gènes résistants aux antibiotiques est une préoccupation croissante car ils ciblent souvent des classes d’antibiotiques de « dernier recours ».

Escherichia coli (E. coli) et Klebsiella pneumoniae les bactéries sont courantes dans les intestins des personnes et des animaux en bonne santé. Des souches hautement résistantes à entérobactéries productrices de bêta-lactamases à spectre étendu (BLSE-E) peuvent provoquer des infections des voies urinaires chez l’homme. Les BLSE-E sont courantes chez les hérissons sauvages européens, mais on sait peu de choses sur les hérissons finlandais en particulier.

Pour le savoir, les chercheurs ont testé des échantillons de 115 hérissons morts en Finlande entre 2020 et 2021. Des écouvillons et des échantillons ont été obtenus sur chaque hérisson pour être testés pour les BLSE-E. Le séquençage du génome entier a été utilisé pour examiner les caractéristiques génomiques de la bactérie, notamment les gènes résistants.

L’équipe de recherche a découvert que 10 pour cent des hérissons avaient au moins une souche bactérienne productrice de SARM et au moins une souche productrice de BLSE.

Seuls trois hérissons étaient porteurs du type de SARM appelé mecC-Le SARM, que l’on trouve couramment en Suède et au Danemark, est apparu chez des patients humains en Europe du Nord au cours des dernières années. Cela suggère qu’il existe une diversité génétique entre les souches de SARM selon les populations et les pays.

Par ailleurs, deux E. coli Les souches identifiées chez les hérissons étaient de types associés à l’homme, ce qui suggère qu’elles auraient pu être transférées des humains aux hérissons.

Venla Johansson de l’Université d’Helsinki, qui a souligné que les hérissons ne sont pas les seuls à être porteurs de bactéries résistantes aux antibiotiques.

« Toute la faune sauvage et le bétail sont porteurs de nombreux types différents de bactéries, il existe donc de nombreux candidats à leur dispersion dans les environnements urbains, y compris les humains eux-mêmes », a expliqué Johansson.

« De plus, des sources anthropiques, telles que les déchets, les eaux de ruissellement agricoles et les eaux usées domestiques, ont été associées à la transmission de la résistance aux antimicrobiens aux animaux sauvages. »

Cette étude observationnelle n’a échantillonné que des hérissons d’une seule ville de Finlande, ce qui signifie que les résultats pourraient ne pas être représentatifs de l’ensemble du pays.

« À l’avenir, le portage du SARM devrait être surveillé chez les hérissons dans différents environnements et dans un contexte géographique plus large afin de déterminer si les hérissons pourraient agir comme une sentinelle de la RAM révélant les niveaux de RAM dans l’environnement », a déclaré Johansson.

Les chercheurs d’une étude précédente publiée dans Nature soulignent que les résultats ne constituent pas une raison de craindre les hérissons, car les humains sont rarement infectés par mecC-MRSA, même s’il est présent chez les hérissons depuis plus de 200 ans.

L’étude a été présentée cette année au Congrès européen de microbiologie clinique et des maladies infectieuses (ECCMID) à Lisbonne, au Portugal.

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Par Katherine Bucko, Espèces-menacées.fr Rédacteur