Le virus du saumon s’est propagé de l’Atlantique au Pacifique

Le saumon quinnat sauvage est d’autant plus susceptible d’être infecté par l’orthoréovirus de Piscine (PRV) qu’il se rapproche des fermes salmonicoles. Cette découverte indique que les élevages propagent le virus au saumon sauvage – une théorie qui est en outre étayée par les résultats d’une analyse génomique récente.

Le Dr Gideon Mordecai est un écologiste viral au Université de la Colombie-Britannique qui a dirigé l’étude.

« Nos méthodes génomiques et épidémiologiques sont toutes deux parvenues indépendamment à la même conclusion, à savoir que les élevages de saumons agissent comme une source et un amplificateur de transmission du RVP », a déclaré le Dr Mordecai. « Comme des sources distinctes de preuves indépendantes pointent toutes vers la même réponse, nous sommes confiants dans nos conclusions. »

En collaboration avec des chercheurs de la Strategic Salmon Health Initiative, l’équipe de l’UBC a retracé les origines du RVP jusqu’aux fermes d’élevage de saumon de l’Atlantique en Norvège et a découvert que le virus est désormais répandu dans les fermes d’élevage de saumon de la Colombie-Britannique.

Après avoir séquencé 86 génomes du PRV, les chercheurs ont estimé que la lignée du virus aujourd’hui présente dans le Pacifique Nord-Est différait de celle du virus présent dans l’océan Atlantique il y a environ 30 ans. Cela donne à penser que l’introduction du RVP en Colombie-Britannique et l’infection du saumon sauvage du Pacifique sont un phénomène relativement récent.

« Il existe une grande confusion quant à l’origine du RVP, à savoir s’il se transmet entre les saumons d’élevage et les saumons sauvages, et à la manière dont les différentes lignées du virus provoquent différentes gravités de la maladie », a déclaré le Dr Mordecai. « Le séquençage du génome de cette étude indique clairement que le réovirus pisciaire n’est pas originaire des eaux de la Colombie-Britannique : il est originaire de l’océan Atlantique et s’est répandu dans le monde entier grâce à la salmoniculture. »

L’analyse génomique a révélé une augmentation du nombre d’infections par le RVP en Colombie-Britannique au cours des dernières décennies. Cela correspond à l’expansion de la salmoniculture et aux taux élevés d’infection virale dans les élevages de saumon.

« Notre découverte selon laquelle le RVP se transmet entre les saumons d’élevage et sauvages est particulièrement pertinente compte tenu des récentes études sur le terrain et en laboratoire montrant que la lignée du RVP en Colombie-Britannique est susceptible de causer des maladies chez le saumon du Pacifique et de l’Atlantique », a déclaré le Dr Mordecai.

Le virus est associé à une maladie du saumon chinook qui provoque la rupture des cellules sanguines, entraînant des lésions rénales et hépatiques pouvant être mortelles.

« Notre étude réaffirme qu’une approche plus prudente dans la gestion de l’élevage du saumon en Colombie-Britannique est justifiée », a déclaré le co-auteur de l’étude, le Dr Andrew Bateman de la Pacific Salmon Foundation. « Les résultats du PRV, en particulier, soutiennent les appels à la transition de l’élevage du saumon en filets ouverts vers une technologie d’élevage qui ne permet pas le transfert de maladies entre le saumon d’élevage et le saumon sauvage, protégeant ainsi le saumon sauvage du Pacifique de la Colombie-Britannique de risques sérieux. »

Le professeur Jeffrey Hutchings de l’Université Dalhousie est un éminent scientifique canadien des pêches qui n’a pas participé à la recherche.

« L’étude fournit les informations fondamentales nécessaires pour évaluer le risque que pose la salmoniculture sur les poissons sauvages, comme le recommande le rapport 2018 du vérificateur général du Canada sur l’élevage du saumon, qui critiquait la capacité du MPO à gérer l’aquaculture de manière prudente », a déclaré le professeur Hutchings.

« Les travaux de Mordecai, Miller et leurs collègues sur le PRV fournissent la preuve scientifiquement objective la plus convaincante à ce jour selon laquelle le saumon sauvage de la Colombie-Britannique présente un risque accru de maladie en raison de l’aquaculture du saumon de l’Atlantique en enclos en filet ouverts.

L’étude est publiée dans la revue Avancées scientifiques.

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Par Chrissy Sexton, Espèces-menacées.fr Rédacteur