La connaissance de l’origine du coronavirus à l’origine de la pandémie actuelle de COVID-19 est encore fragmentaire. Récemment, une équipe de scientifiques a découvert des coronavirus étroitement liés au SRAS-CoV-2 provenant de deux chauves-souris échantillonnées au Cambodge il y a plus de dix ans.
Ces découvertes, ainsi que la découverte récente des ancêtres les plus proches du SRAS-CoV-2 chez des chauves-souris troglodytes au Laos, indiquent que les coronavirus ont une répartition géographique plus large qu’on ne le pensait auparavant, et soutiennent la théorie selon laquelle la pandémie est née d’une propagation des chauves-souris. .
En utilisant le séquençage métagénomique, les chercheurs ont identifié des virus presque identiques au SRAS-CoV-2 chez deux chauves-souris fer à cheval de Shamel (Rhinolophus shaméli) qui ont été initialement échantillonnés en 2010. Ces résultats suggèrent que les coronavirus liés au SRAS-CoV-2 circulent probablement via une diversité de Rhinolophus espèces.
Selon les auteurs de l’étude, les connaissances actuelles sur la répartition géographique des lignées du SRAS-CoV-1 et du SRAS-CoV-2 reflètent probablement un manque d’échantillonnage dans les pays d’Asie du Sud-Est, notamment le Cambodge, le Laos, le Myanmar, la Thaïlande et le Vietnam, ainsi que ainsi que plusieurs provinces chinoises, comme le Yunnan et le Guanxi.
Outre les chauves-souris, les pangolins et plusieurs espèces de chats, civettes et belettes trouvées dans ces zones sont très sensibles aux infections à coronavirus et pourraient représenter des hôtes intermédiaires pour la transmission à l’homme. Lors d’opérations anti-contrebande en provenance de Chine en 2020, des virus liés au SRAS-CoV-2 ont été découverts dans des groupes distincts de pangolins, renforçant encore cette hypothèse.
« Ces résultats soulignent l’importance d’un investissement accru à l’échelle régionale dans la capacité de transition pour une surveillance durable des agents pathogènes dans la faune sauvage, grâce à des initiatives telles que WildHealthNet », a déclaré Lucy Keatts, co-auteur de l’étude et conseillère en santé à la Wildlife Conservation Society.
« L’Asie du Sud-Est abrite une grande diversité d’espèces sauvages et un commerce important d’espèces sauvages qui met les humains en contact direct avec des hôtes sauvages de coronavirus de type SRAS. La région subit des changements spectaculaires dans l’utilisation des terres, tels que le développement des infrastructures, le développement urbain et l’expansion agricole, qui peuvent accroître les contacts entre les chauves-souris, d’autres animaux sauvages, les animaux domestiques et les humains. La surveillance continue et élargie des chauves-souris et d’autres animaux sauvages clés en Asie du Sud-Est est un élément crucial de la préparation et de la prévention des futures pandémies.
L’étude est publiée dans la revue Communications naturelles.
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Par Andreï Ionescu, Espèces-menacées.fr Rédacteur
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