Le système digestif contient un microbiome magnifiquement dynamique. Et lorsqu’un élément change, d’autres parties changent généralement également. Les intestins des chiens suivent ce même schéma. Avec les changements alimentaires, les microbes intestinaux évoluent à mesure que les différentes espèces trouvent leur rôle dans un nouvel environnement. Le changement dans la diversité microbienne affecte les types de sous-produits, appelés métabolites, qui sont produits dans l’intestin.
Les scientifiques le savent déjà, c’est pourquoi on nous dit généralement de modifier progressivement l’alimentation de notre chien. Pourtant, ils ne savaient pas à quelle vitesse les microbiomes s’adaptent à un nouveau régime.
« Depuis que je fais des recherches sur la nutrition animale, nous discutons de la durée pendant laquelle nous devons nourrir un nouveau régime avant de collecter des échantillons lorsque tout est stabilisé », a déclaré Kelly Swanson, co-auteur de l’étude. « Personne ne l’a jamais testé de manière définitive. »
Les résultats de l’étude ont révélé que les microbes intestinaux chez les chiens trouvent rapidement leur équilibre. « Les métabolites changent très rapidement, en quelques jours. Les bactéries métabolisent et gèrent de manière réactive les substrats qui leur sont donnés dans le nouveau régime. Ensuite, il faut encore quelques jours pour régler la hiérarchie microbienne, si vous voulez », a expliqué Swanson.
« Nos données montrent que tout se stabilise au sixième jour, de sorte que les chercheurs en nutrition animale peuvent échantillonner en toute confiance et trouver un microbiome stable en 10 jours. »
Pour mener à bien leur étude, les chercheurs ont nourri des chiens avec des croquettes sèches pendant deux semaines et ont soudainement modifié leur régime alimentaire. La moitié des chiens mangeaient des aliments en conserve riches en graisses et en protéines, et l’autre des croquettes riches en fibres. Ils ont répété l’étude en échangeant une deuxième fois des chiens avec le régime expérimental opposé.
Les experts ont prélevé des échantillons de selles deux jours après le changement, puis tous les quatre jours par la suite. Ils ont analysé les excréments et ont ensuite lié les métabolites aux espèces bactériennes, ce qui n’est pas une tâche facile.
«Souvent, nous nourrissons un régime et collectons les excréments, mais il existe une sorte de boîte noire en ce qui concerne ce qui se passe dans l’intestin. Nous savons ce que certaines espèces bactériennes métabolisent, mais une grande partie est certainement inconnue », a déclaré Swanson. « Nos corrélations sont le point de départ pour relier certains points, mais des recherches plus ciblées doivent encore être menées. »
Selon les chercheurs, la connaissance la plus surprenante issue de l’étude est la rapidité avec laquelle le corps des chiens peut réagir à un changement de régime alimentaire. Les experts estiment que d’autres mammifères pourraient atteindre l’équilibre bactérien dans un délai similaire.
L’étude est publiée dans Microbiome Animal.
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Par Erin Maugrey , Espèces-menacées.fr Rédacteur
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